Page rank módszer a biológiában

A Google PageRank algoritmusa számokat rendel a hiperlinkekkel összekötött dokumentumokhoz azoknak a hiperlinkhálózatban betöltött szerepe alapján. A Google arra a feltételezésre épít, hogy a weboldalak készítői általában azokra az oldalakra linkelnek a saját lapjukról, amelyeket jónak tartanak, vagyis minden hiperlink felfogható egy-egy szavazatként a céloldalra. Minél több szavazatot kap egy oldal, annál fontosabb, de azt is figyelembe kell venni, hogy a szavazatot leadó oldal mennyire fontos. A PageRank a fontosság számszerűsítése.

Stefano Allesina, a Santa Barbara-i Kaliforniai Egyetem Ökológiai Analízis és Szintézis Nemzeti Központjának munkatársa, valamint Mercedes Pascual, az Ann Arbor-i Michigani Egyetem ökológiai és evolúciós biológiai tanszékének kutatója a természetbe próbálja átültetni ezt a megközelítésmódot. Megállapították, hogy a PageRank algoritmust adaptálni lehet a táplálékhálózatok tanulmányozására. A táplálékhálózatok azok az összetett hálózatok, amelyek azt írják le, ki kit eszik meg az ökoszisztémában. Cikkük a szabadon hozzáférhető online folyóirat augusztusi számában jelent meg.

Allesina és Pascual szerint alapvetően azok a fajok a leglényegesebbek, ha más fajok fennmaradása függ a saját fennmaradásától, elegendő nagyságú állományától. Ezek azok a fajok, amelyek legalábbis közvetve a legtöbb más fajjal vannak kapcsolatban (azaz "jó a page rank-jük"). A kutatók szerint éppen ezért ezeknek a fajoknak a megóvására kell helyezni a hangsúlyt, és nem az egyébként látványos, de az ökoszisztéma szempontjából kevésbé fontos élőlényekére.

Ez a megközelítés ellentétben áll mások ökoszisztémával kapcsolatos felfogásával, akik "csillagpontos" megközelítést alkalmaznak: itt a fajokat aszerint rangsorolják, hogy hány más faj kapcsolódik hozzájuk közvetlenül a táplálékhálózat révén. A mostani tanulmány szerzői szerint ez a módszer - amely a kapcsolatok számát hangsúlyozza - nem veszi figyelembe a faj helyzetét a táplálékhálóban, és azokat a továbbgyűrűző hatásokat, amelyeket az eltávolítása okozna.

Nem könnyű egy olyan matematikai egyenlettel előrukkolni, amellyel meg lehet határozni egy ökoszisztéma legmagasabb rangú vagy legfontosabb faját. Allesina és Pascual tulajdonképpen visszafelé gondolkodtak: "Azt tanulmányoztuk, hogy tudjuk a leghatékonyabb módon lerombolni a biodiverzitást, a biológiai sokféleséget annak érdekében, hogy megvizsgáljuk, mely fajok eltávolítása okozza a legtöbb kárt"

Forrás: Origo és az eredeti cikk.

Beépített mikroszkóp

A minap vettem észre az égre, nagyobb világosabb felületre, monitorra tekintve, hogy valami úszkál a szememben. Kis szál, bögökkel. Persze jól megijedtem először, majd körülnéztem a neten. Magyarul uszadékoknak vagy üvegtesi homálynak hívják ezt a jelenséget. Kiderült, hogy az emberek többsége rendelkezik ilyennel, csak nem vesz róla tudomást. Persze az is kiderült, hogy vannak nagyon durva esetek, amikor nem lehet nem venni róla tudomást. Nekem csak egy szál úszkál a szememben.

De mi is ez valójában?

A szemgolyónak nincs anyagcseréje, azaz nincsenek benne erek, mert akkor nem látnánk át rajtuk. De ahhoz hogy az embrió korban ki tudjon fejlődni a szem, tápanyagok kellenek, tehát erek. A születés előtt, amikor a szem már kifejlődött, ezek az erek felszívódnak. Mivel tökéletes szervezet nincs, a felszívódás sem az, visszamaradnak az erek darabkái.
Másképp is keletkeznek ilyen foltok a későbbiekben, egyrészt ahogy az ember idősödik a szemgolyó összemegy, így sűrűsödik benne a gél, ami nem egyenletesen történik. Ahol sűrűbb lesz, ott foltokat látunk. Lényegében protein szálakat, és a szemünk retináján, mint egy tökéletes beépített mikroszkópon, árnyékot hagynak.
Ezek, a retinához nagyon közeli kis darabok elég kellemetlenek tudnak lenni, ám többnyire bonyolult vagy lehetetlen meglelni az orvosnak, és lehetetlen fényképezni is őket. Ezért kezelni sem lehet őket.
A másik már kezelhető és kezelendő is: ha valamiért sérül a retina, akkor vér kerül az üvegtestbe ami szintén foltokat okoz. Utóbbi kizárása miatt egyszer el kell menni a szemészetre egy retina vizsgálatra. Ha a foltok számában és méretében változás következik be, akkor is mindenképpen menjünk el orvoshoz. A szemész szemtükrözést végez, ami fájdalommentes és gyors. Ezzel ki tudja zárni az utóbbi esetet, illetve megkérdezhetjük tőle, hogy lát-e valamit a szemünkben.

Ezen az oldalon a sorstársak gyűltek össze (itt) és kiderült, hogy a komolyabb esetek esetén van egy lézeres műtét, ami segíthet. Ha azonban az illető 55 évnél fiatalabb, akkor valószínű hogy olyan esettel áll szemben, amikor a doki nem is látja az uszadékát. És persze ekkor nem is tehető semmi.

Állítólag "a gépjárművezetők, a számítógéppel, légkondicionált irodában dolgozók, a tévé előtt ülők, az UV-sugárzásnak, huzatnak és pornak kitett személyek leggyakoribb panasza. És a tünetegyüttes 40 év felett szinte biztosan jelentkezik."
Olvastam olyat is, aki kezdődő betegségeknél észleli csak, és egy kalmopyrin bevétele után elmúlik neki. Javasolják még a táplálkozási szokások megváltoztatását, vitaminokat és a leghatásosabbat: a figyelemelterelést.
Ez a videó egy szimulációs programot mutat be. Tessék beletekerni, mert nem töltődik valami gyorsan:

Az alábbi videó azt hiszem egy prezentációhoz készült, szinte az összes a témában fellelhető képet lehet benne látni:

Kutatók éjszakája

Idén is megrendezik szeptember 25-én a Kutatók Éjszakáját. Talán kicsit korainak tűnik a figyelemfelhívás, de nem az. Sőt én már elkéstem. Ugyanis sok programra regisztráció szükséges, és pont az engem érdeklő előadásokra minden hely elfogyott. Érdemes körülnézni, ahogy láttam még vannak szabad helyek. Állati érdekes témákról lesz szó! Programok az ELTÉn, a MŰSZAKIN, az ORVOSIN és a MILLENÁRSON.

Ez ám a leértékelés!

A Lehel téri metróaluljáróban találtam felfelé tekintve ezt a kihagyhatatlan ajánlatot...

Unatkozol? Fújj CD-t!

Ha unatkozol, fújj buborékot megunt CD-dből:
Ha kicsit több magyarázatra van szükséged, akkor ezt nézd meg:

Tájfutó világbajnokság 2009 - Miskolc

2009. augusztus 15-e és 23-a között Magyarországon, Miskolc környékén volt a 2009-es tájfutó világbajnokság. És bár elméletileg a "magyar média" képviselői is jelen voltak, szinte a nullával egyenlő azon cikkek és riportok száma, ami a magyar médiában fellelhető. Az itthoni eseményekről egyszerűbb volt és részletesebb képet kapott, aki például a svéd cikkek közt böngészett. Sokak szerint érthető, hiszen ekkor volt az atlétikai világbajnokság és kenuban is több aranyat hoztunk. És hát végül is a tájfutás nem olimpiai sportág...de azért engem bosszant, hogy míg holmi foci világbajnokság rendezési tervről mindenki tud, ha végre tényleg rendezünk valamit az annyira sem méltó, hogy az m1 sport hírei közt két mondatot kapjon.

Pedig a versenyek felettébb izgalmasak voltak. Volt tévés pont, így úgy-ahogy lehet követni, hogy ki hol tart a pályán. Illetve némely számokon GPS adóval futottak a versenyzők és a térképen lehetett követni ki merre jár, mennyire pontosan tájékozódik. Utóbbira két szép kis videót mutatnék. Mindkettő a váltón készült. Ekkor tömegrajt van, szinte mindig együtt futnak a jók. A férfiaknál a világbajnok Thierry Gueorgiou nem találja az 5-ös pontot, majd utolérik a többiek és a segítségükkel csak meglesz neki is :

A nőknél ugyancsak a váltón az ötös pont sikerült nehéznek. Simone Niggli, a svájciak világbajnoka vezetett, de ezt a pontot csak nem találta. Beérték, de nem vette észre, hogy a többieknek megvolt a pont, és még mindig kereste, aztán hosszas keresés után azért csak meglett....Svájc így a negyedik helyen végzett.

De azt hiszem, amitől ezt a világversenyt senki nem fogja elfelejteni, az a férfi váltóban történt meglepő, drámai és rendkívűl sportszerű történet lesz.
Érdemes elolvasnia annak, aki nem szereti ha lelövik a poént, az aznapi rövid kis jegyzeteket a WorldofO oldal alján, mert nagyon jól visszahozza, hogy mi történt akkor,ott. De a Kispadon is van egy hosszabb cikk erről, és ami kicsit jobban megmagyarázza, hogy mi is az a váltó.

Azért röviden összegzem, hogy mi is történt: A GPS jelek szerint a férfi váltó élbolya egyszercsak leállt. Majd a norvég Anders Nordberg a célfelé fut, teljesen nem arra, amerre kellene neki. Mikor beért akkor derült ki, hogy a svéd Martin Johansson combjába 12 cm mélyen egy faág állt. A már említett francia Thierry Gueorgiou megállt, hogy segítsen neki, mezével és GPS tartó övével elszorította a vérzést. A kicsit később odaérő cseh Michal Smola is velük maradt, míg megérkezett a segítség. Majd bekocogtak a célba a a 25-27 helyen (itt jegyzem meg, hogy még így is sikerült 11 csapatot megelőzniük :) )
A fenti emberek feladták a világbajnoki címüket, hogy segítsenek egy bajbajutott társuknak/ellenfelüknek. Na ilyen egy atlétikai világbajnokságon nincsen.

Itt egy videó, ahol a három hős beér. Az átfutó ponton Johansson szülei ölelgetik őket, és Thierry akkor adja nekik oda a faágat. (A "Silver till damerna och Martin Johansson till sjukhus"-ra kell kattintani.)
Itt egy angolul beszélő riport velük, ahol elmondják mi is történt:

És bár még rengeteg élményben volt részünk: rettentő izgalmasak voltak a rövid és hosszútáv döntői, a mikrosprint is rém látványos volt, természetesen nem tudom mindet leírni - így is elég hosszúra sikerült a poszt. A tájfutó világbajnokság hivatalos honlapját érdemes még megnézni. Fent vannak az eredmények, beszámolók, utózöngék.

Nyári szünet

Az elmúlt idők pangása nem a nyárnak, hanem egyéb munkáknak és eseményeknek tudható be, most viszont igazi nyári szabadságra megyek: egy ideig szüneteltetem a blog írást.

Mindenkinek kellemes nyarat, jó feltöltődést, és sok-sok élményt kívánok!